El nombre de Lanuza parece derivar del término celta latinizado landa o lana, que significa "ladera", dándose la circunstancia de que el paraje circundante al pueblo (hoy sumergido) es efectivamente una ladera que en su día estuvo ocupada por extensas praderas y pastos. Su existencia aparece documentada desde el siglo XIII y en 1488 ya contaba con 20 hogares. Junto con Sallent, formaba uno de los tres históricos quiñones en los que se dividía administrativamente el Valle de Tena.

Próspera y eminentemente ganadera en sus orígenes, la construcción del Embalse de Lanuza en 1976 provocó el paulatino y forzado despoblamiento de la localidad hasta quedar completamente deshabitada en 1978. Víctima del expolio y el abandono, en la década de los 90 los antiguos moradores consiguieron recuperar las propiedades no sumergidas e iniciaron un proceso de revitalización que sigue activo.